Biro Audit Internal keuangan yang bertugas menjaga akuntabilitas keuangan lembaga maupun prodi di UMS menjalankan misi audit persemester mendampingi program audit internal mutu yang telah berjalan. Di pimpin ibu Dra. Rina Trisnawati, M.Si.Ak., Ph.D. audit sementara masih mengikuti aturan terbatas yang digunakan pada panduan rpps, yang dirasa belum maksimal, dan temuan akan merekam tata kelola keuangan pada bendahara diantaranya transaksi keluar masuk pembukuan dan rekening pada LJM untuk melihat pengelolaan yang terjadi sehingga kedepan pengelolaan menjadi lebih baik, demikian yang disampaikan pada pengantar  pembukaan audit.